Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCQQ04759 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCQQ04759 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms