Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN1Q04323 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN1Q04323 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN1Q04323 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms