Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHLH1Q02575 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHLH1Q02575 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NHLH1Q02575 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms