Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX5Q02548 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms