Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPEQ02224 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPEQ02224 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms