Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
XPCQ01831 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
XPCQ01831 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
XPCQ01831 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
XPCQ01831 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
XPCQ01831 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
XPCQ01831 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
XPCQ01831 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
XPCQ01831 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
XPCQ01831 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
XPCQ01831 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
XPCQ01831 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
XPCQ01831 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
XPCQ01831 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
XPCQ01831 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
XPCQ01831 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
XPCQ01831 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
XPCQ01831 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
XPCQ01831 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
XPCQ01831 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
XPCQ01831 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
XPCQ01831 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
XPCQ01831 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
XPCQ01831 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
XPCQ01831 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
XPCQ01831 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
XPCQ01831 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
XPCQ01831 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
XPCQ01831 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
XPCQ01831 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
XPCQ01831 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
XPCQ01831 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
XPCQ01831 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
XPCQ01831 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
XPCQ01831 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
XPCQ01831 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
XPCQ01831 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
XPCQ01831 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
XPCQ01831 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
XPCQ01831 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
XPCQ01831 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
XPCQ01831 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
XPCQ01831 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
XPCQ01831 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
XPCQ01831 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
XPCQ01831 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
XPCQ01831 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
XPCQ01831 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
XPCQ01831 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
XPCQ01831 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
XPCQ01831 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
XPCQ01831 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
XPCQ01831 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
XPCQ01831 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
XPCQ01831 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
XPCQ01831 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
XPCQ01831 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
XPCQ01831 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
XPCQ01831 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
XPCQ01831 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
XPCQ01831 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
XPCQ01831 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
XPCQ01831 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
XPCQ01831 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
XPCQ01831 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
XPCQ01831 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
XPCQ01831 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
XPCQ01831 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
XPCQ01831 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
XPCQ01831 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
XPCQ01831 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
XPCQ01831 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
XPCQ01831 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
XPCQ01831 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
XPCQ01831 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
XPCQ01831 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
XPCQ01831 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
XPCQ01831 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
XPCQ01831 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
XPCQ01831 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
XPCQ01831 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
XPCQ01831 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
XPCQ01831 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
XPCQ01831 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
XPCQ01831 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
XPCQ01831 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
XPCQ01831 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
XPCQ01831 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
XPCQ01831 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
XPCQ01831 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
XPCQ01831 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
XPCQ01831 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
XPCQ01831 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
XPCQ01831 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
XPCQ01831 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
XPCQ01831 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
XPCQ01831 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
XPCQ01831 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
XPCQ01831 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
XPCQ01831 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms