Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F1Q01094 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
E2F1Q01094 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms