Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF5P84085 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF5P84085 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF5P84085 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF5P84085 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF5P84085 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF5P84085 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF5P84085 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF5P84085 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF5P84085 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF5P84085 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF5P84085 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF5P84085 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF5P84085 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF5P84085 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF5P84085 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF5P84085 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF5P84085 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF5P84085 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF5P84085 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF5P84085 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF5P84085 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF5P84085 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF5P84085 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF5P84085 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF5P84085 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF5P84085 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF5P84085 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF5P84085 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF5P84085 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF5P84085 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF5P84085 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF5P84085 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF5P84085 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF5P84085 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF5P84085 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF5P84085 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARF5P84085 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARF5P84085 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF5P84085 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF5P84085 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF5P84085 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF5P84085 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF5P84085 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF5P84085 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF5P84085 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF5P84085 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF5P84085 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF5P84085 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF5P84085 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARF5P84085 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARF5P84085 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARF5P84085 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARF5P84085 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARF5P84085 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARF5P84085 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARF5P84085 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARF5P84085 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARF5P84085 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARF5P84085 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARF5P84085 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARF5P84085 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARF5P84085 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARF5P84085 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARF5P84085 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARF5P84085 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARF5P84085 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARF5P84085 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARF5P84085 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARF5P84085 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARF5P84085 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARF5P84085 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARF5P84085 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARF5P84085 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARF5P84085 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARF5P84085 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARF5P84085 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARF5P84085 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARF5P84085 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARF5P84085 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARF5P84085 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARF5P84085 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARF5P84085 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARF5P84085 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARF5P84085 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARF5P84085 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARF5P84085 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARF5P84085 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARF5P84085 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARF5P84085 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARF5P84085 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARF5P84085 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARF5P84085 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARF5P84085 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARF5P84085 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARF5P84085 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARF5P84085 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARF5P84085 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARF5P84085 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARF5P84085 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms