Protein–RNA interactions for Protein: P80723

BASP1, Brain acid soluble protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BASP1P80723 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BASP1P80723 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BASP1P80723 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BASP1P80723 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BASP1P80723 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BASP1P80723 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BASP1P80723 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BASP1P80723 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BASP1P80723 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BASP1P80723 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BASP1P80723 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BASP1P80723 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BASP1P80723 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BASP1P80723 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BASP1P80723 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BASP1P80723 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BASP1P80723 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BASP1P80723 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BASP1P80723 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BASP1P80723 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BASP1P80723 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BASP1P80723 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BASP1P80723 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BASP1P80723 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BASP1P80723 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BASP1P80723 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BASP1P80723 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BASP1P80723 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BASP1P80723 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BASP1P80723 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BASP1P80723 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BASP1P80723 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BASP1P80723 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BASP1P80723 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BASP1P80723 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BASP1P80723 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BASP1P80723 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BASP1P80723 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BASP1P80723 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BASP1P80723 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BASP1P80723 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BASP1P80723 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BASP1P80723 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BASP1P80723 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BASP1P80723 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BASP1P80723 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BASP1P80723 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BASP1P80723 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BASP1P80723 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BASP1P80723 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BASP1P80723 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BASP1P80723 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BASP1P80723 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BASP1P80723 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BASP1P80723 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BASP1P80723 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BASP1P80723 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BASP1P80723 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BASP1P80723 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BASP1P80723 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BASP1P80723 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BASP1P80723 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BASP1P80723 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BASP1P80723 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BASP1P80723 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BASP1P80723 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BASP1P80723 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BASP1P80723 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BASP1P80723 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BASP1P80723 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BASP1P80723 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BASP1P80723 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BASP1P80723 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms