Protein–RNA interactions for Protein: P78344

EIF4G2, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G2P78344 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.878e-7■■■■■ 47.1
EIF4G2P78344 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.788e-7■■■■■ 47.1
EIF4G2P78344 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.498e-7■■■■■ 47.1
EIF4G2P78344 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 522.76■■□□□ 1.238e-7■■■■■ 47.1
EIF4G2P78344 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.028e-7■■■■■ 47.1
EIF4G2P78344 PFKP-206ENST00000415005 1140 ntTSL 218.89■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 47
EIF4G2P78344 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 522.2■■□□□ 1.149e-7■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 226.09■■□□□ 1.776e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.656e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.596e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 424.73■■□□□ 1.556e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 524.67■■□□□ 1.546e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.97■■□□□ 1.436e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 223.42■■□□□ 1.346e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 421.54■■□□□ 1.046e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.68■□□□□ 0.96e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.38■□□□□ 0.856e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 218.85■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.856e-8■■■■■ 46.9
EIF4G2P78344 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 46.8
EIF4G2P78344 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 46.8
EIF4G2P78344 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 46.8
EIF4G2P78344 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 46.8
EIF4G2P78344 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.679e-7■■■■■ 46.8
EIF4G2P78344 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 46.8
EIF4G2P78344 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.429e-7■■■■■ 46.8
EIF4G2P78344 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.081e-9■■■■■ 46.7
EIF4G2P78344 LONRF1-206ENST00000527055 769 ntTSL 212.05□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 46.7
EIF4G2P78344 LONRF1-205ENST00000526680 2841 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.611e-9■■■■■ 46.7
EIF4G2P78344 NUDC-202ENST00000435827 821 ntTSL 531.08■■■□□ 2.572e-24■■■■■ 46.7
EIF4G2P78344 NUDC-203ENST00000452707 816 ntTSL 331.08■■■□□ 2.572e-24■■■■■ 46.7
EIF4G2P78344 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.622e-24■■■■■ 46.7
EIF4G2P78344 EIPR1-213ENST00000482570 582 ntTSL 216.93■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.495e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.283e-9■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.195e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 AAK1-210ENST00000495836 965 ntTSL 1 (best)27.45■■□□□ 1.985e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.865e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.835e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.85e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.723e-9■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.595e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 224.16■■□□□ 1.465e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.365e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.295e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ETFB-203ENST00000593992 603 ntTSL 221.8■■□□□ 1.085e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.075e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ETFB-205ENST00000596253 575 ntTSL 320.96■□□□□ 0.955e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.695e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.595e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.555e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.45e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.315e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.285e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 LRRC8A-202ENST00000372599 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.265e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.445e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 TMEM206-202ENST00000467822 742 ntTSL 310.96□□□□□ -0.653e-9■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ANK3-204ENST00000373820 2358 ntTSL 28.59□□□□□ -1.035e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ANK3-224ENST00000610321 4930 ntTSL 58.13□□□□□ -1.115e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.145e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 MRPL3-206ENST00000510043 640 ntTSL 27.78□□□□□ -1.165e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ANK3-221ENST00000511043 562 ntTSL 37.51□□□□□ -1.215e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.215e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.365e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ANK3-228ENST00000616444 2939 ntTSL 55.92□□□□□ -1.465e-11■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 221.33■■□□□ 1.014e-20■■■■■ 46.6
EIF4G2P78344 ZFYVE28-206ENST00000508471 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 46.4
EIF4G2P78344 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 231.44■■■□□ 2.623e-7■■■■■ 46.4
EIF4G2P78344 TRAPPC9-211ENST00000521700 548 ntTSL 324.93■■□□□ 1.588e-7■■■■■ 46.4
EIF4G2P78344 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.551e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 NDST1-206ENST00000522491 777 ntTSL 229.27■■■□□ 2.281e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 527.55■■■□□ 21e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.71e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 NDST1-202ENST00000518299 769 ntTSL 223.66■■□□□ 1.381e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 CCDC88C-209ENST00000554872 1165 ntTSL 422.37■■□□□ 1.171e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 NDST1-203ENST00000518346 496 ntTSL 321.35■■□□□ 1.011e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 NDST1-208ENST00000524161 437 ntTSL 221.03■□□□□ 0.961e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 CCDC88C-208ENST00000554165 420 ntTSL 316.19■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 CCDC88C-206ENST00000553437 550 ntTSL 214.34□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 46.2
EIF4G2P78344 PTP4A2-215ENST00000533408 376 ntTSL 329.74■■■□□ 2.357e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 PTP4A2-212ENST00000529477 568 ntTSL 326.61■■□□□ 1.857e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 PTP4A2-214ENST00000532289 610 ntTSL 325.92■■□□□ 1.747e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 PTP4A2-209ENST00000526960 793 ntTSL 519.74■□□□□ 0.757e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 PTP4A2-211ENST00000528840 456 ntTSL 215.61■□□□□ 0.097e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 PTP4A2-216ENST00000534796 900 ntTSL 314.72□□□□□ -0.057e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 PTP4A2-204ENST00000475464 366 ntTSL 313.93□□□□□ -0.187e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 PTP4A2-208ENST00000524384 663 ntTSL 510.76□□□□□ -0.697e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 PTP4A2-202ENST00000468531 830 ntTSL 38.52□□□□□ -1.057e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 PTP4A2-207ENST00000494444 678 ntTSL 58.4□□□□□ -1.067e-15■■■■■ 46
EIF4G2P78344 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.183e-7■■■■■ 46
EIF4G2P78344 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.073e-7■■■■■ 46
EIF4G2P78344 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.033e-7■■■■■ 46
EIF4G2P78344 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.83e-7■■■■■ 46
EIF4G2P78344 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 519.04■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 46
EIF4G2P78344 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 216.15■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 46
Retrieved 100 of 8,962 protein–RNA pairs in 444.7 ms