Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2LP62875 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2LP62875 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2LP62875 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2LP62875 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms