Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UFM1P61960 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UFM1P61960 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UFM1P61960 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UFM1P61960 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UFM1P61960 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UFM1P61960 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UFM1P61960 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UFM1P61960 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UFM1P61960 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UFM1P61960 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UFM1P61960 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UFM1P61960 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UFM1P61960 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UFM1P61960 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UFM1P61960 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UFM1P61960 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UFM1P61960 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFM1P61960 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFM1P61960 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFM1P61960 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFM1P61960 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFM1P61960 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFM1P61960 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFM1P61960 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UFM1P61960 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFM1P61960 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFM1P61960 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFM1P61960 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFM1P61960 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFM1P61960 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFM1P61960 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFM1P61960 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFM1P61960 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFM1P61960 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFM1P61960 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UFM1P61960 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFM1P61960 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFM1P61960 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFM1P61960 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFM1P61960 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFM1P61960 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFM1P61960 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFM1P61960 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFM1P61960 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFM1P61960 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UFM1P61960 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UFM1P61960 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UFM1P61960 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UFM1P61960 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UFM1P61960 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UFM1P61960 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UFM1P61960 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UFM1P61960 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UFM1P61960 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UFM1P61960 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UFM1P61960 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UFM1P61960 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UFM1P61960 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UFM1P61960 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UFM1P61960 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UFM1P61960 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UFM1P61960 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UFM1P61960 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UFM1P61960 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UFM1P61960 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UFM1P61960 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UFM1P61960 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UFM1P61960 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UFM1P61960 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UFM1P61960 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UFM1P61960 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UFM1P61960 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UFM1P61960 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UFM1P61960 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UFM1P61960 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UFM1P61960 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UFM1P61960 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UFM1P61960 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFM1P61960 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFM1P61960 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFM1P61960 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFM1P61960 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFM1P61960 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFM1P61960 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFM1P61960 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFM1P61960 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFM1P61960 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFM1P61960 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFM1P61960 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFM1P61960 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFM1P61960 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFM1P61960 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFM1P61960 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFM1P61960 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFM1P61960 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFM1P61960 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFM1P61960 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
UFM1P61960 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFM1P61960 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms