Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CXCR4P61073 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR4P61073 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR4P61073 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms