Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms