Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM11AP58511 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM11AP58511 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM11AP58511 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms