Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GSDMDP57764 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GSDMDP57764 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms