Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH13P55290 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH13P55290 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH13P55290 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH13P55290 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH13P55290 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH13P55290 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH13P55290 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH13P55290 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH13P55290 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH13P55290 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH13P55290 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH13P55290 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH13P55290 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH13P55290 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH13P55290 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH13P55290 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH13P55290 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH13P55290 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH13P55290 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH13P55290 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH13P55290 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH13P55290 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH13P55290 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH13P55290 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH13P55290 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH13P55290 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH13P55290 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDH13P55290 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH13P55290 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH13P55290 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH13P55290 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH13P55290 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH13P55290 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH13P55290 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH13P55290 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH13P55290 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH13P55290 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH13P55290 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH13P55290 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH13P55290 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH13P55290 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH13P55290 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH13P55290 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH13P55290 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH13P55290 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH13P55290 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH13P55290 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH13P55290 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH13P55290 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH13P55290 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH13P55290 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH13P55290 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH13P55290 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH13P55290 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH13P55290 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH13P55290 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms