Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP6P55212 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP6P55212 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP6P55212 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP6P55212 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP6P55212 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP6P55212 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP6P55212 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP6P55212 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP6P55212 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP6P55212 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP6P55212 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP6P55212 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP6P55212 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP6P55212 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP6P55212 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP6P55212 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP6P55212 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP6P55212 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP6P55212 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP6P55212 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP6P55212 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP6P55212 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP6P55212 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP6P55212 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP6P55212 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP6P55212 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP6P55212 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP6P55212 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP6P55212 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP6P55212 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP6P55212 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP6P55212 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP6P55212 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP6P55212 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP6P55212 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP6P55212 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP6P55212 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP6P55212 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP6P55212 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP6P55212 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP6P55212 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP6P55212 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP6P55212 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP6P55212 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP6P55212 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP6P55212 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP6P55212 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP6P55212 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP6P55212 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP6P55212 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP6P55212 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP6P55212 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP6P55212 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP6P55212 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP6P55212 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP6P55212 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP6P55212 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP6P55212 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP6P55212 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP6P55212 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP6P55212 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP6P55212 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP6P55212 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP6P55212 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP6P55212 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP6P55212 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP6P55212 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP6P55212 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP6P55212 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP6P55212 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP6P55212 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP6P55212 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP6P55212 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP6P55212 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP6P55212 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP6P55212 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP6P55212 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP6P55212 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP6P55212 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP6P55212 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP6P55212 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP6P55212 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP6P55212 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP6P55212 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP6P55212 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP6P55212 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP6P55212 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP6P55212 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP6P55212 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP6P55212 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms