Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF10P55107 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF10P55107 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF10P55107 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF10P55107 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF10P55107 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF10P55107 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF10P55107 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF10P55107 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF10P55107 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF10P55107 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF10P55107 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF10P55107 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF10P55107 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF10P55107 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF10P55107 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF10P55107 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF10P55107 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF10P55107 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF10P55107 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF10P55107 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF10P55107 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF10P55107 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF10P55107 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF10P55107 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF10P55107 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF10P55107 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF10P55107 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF10P55107 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF10P55107 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF10P55107 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF10P55107 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF10P55107 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF10P55107 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF10P55107 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF10P55107 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF10P55107 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF10P55107 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF10P55107 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF10P55107 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF10P55107 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF10P55107 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF10P55107 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF10P55107 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF10P55107 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF10P55107 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF10P55107 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF10P55107 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF10P55107 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF10P55107 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF10P55107 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF10P55107 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF10P55107 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF10P55107 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF10P55107 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF10P55107 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF10P55107 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF10P55107 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF10P55107 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF10P55107 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF10P55107 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF10P55107 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF10P55107 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF10P55107 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF10P55107 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF10P55107 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF10P55107 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF10P55107 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF10P55107 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF10P55107 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF10P55107 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF10P55107 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF10P55107 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF10P55107 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF10P55107 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF10P55107 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF10P55107 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF10P55107 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF10P55107 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF10P55107 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms