Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IST1P53990 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IST1P53990 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IST1P53990 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IST1P53990 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IST1P53990 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IST1P53990 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IST1P53990 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IST1P53990 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IST1P53990 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IST1P53990 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IST1P53990 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IST1P53990 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IST1P53990 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IST1P53990 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IST1P53990 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IST1P53990 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IST1P53990 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IST1P53990 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IST1P53990 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IST1P53990 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IST1P53990 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IST1P53990 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IST1P53990 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IST1P53990 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IST1P53990 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IST1P53990 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IST1P53990 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IST1P53990 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IST1P53990 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IST1P53990 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IST1P53990 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IST1P53990 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IST1P53990 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IST1P53990 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IST1P53990 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IST1P53990 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IST1P53990 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IST1P53990 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IST1P53990 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IST1P53990 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IST1P53990 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IST1P53990 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IST1P53990 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IST1P53990 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IST1P53990 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IST1P53990 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IST1P53990 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IST1P53990 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IST1P53990 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IST1P53990 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IST1P53990 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IST1P53990 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IST1P53990 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IST1P53990 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IST1P53990 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IST1P53990 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IST1P53990 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IST1P53990 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IST1P53990 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IST1P53990 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IST1P53990 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IST1P53990 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IST1P53990 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IST1P53990 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IST1P53990 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IST1P53990 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IST1P53990 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IST1P53990 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IST1P53990 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IST1P53990 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IST1P53990 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IST1P53990 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IST1P53990 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IST1P53990 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IST1P53990 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IST1P53990 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IST1P53990 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IST1P53990 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IST1P53990 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IST1P53990 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IST1P53990 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms