Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RABGGTBP53611 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABGGTBP53611 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTBP53611 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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