Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUCLG1P53597 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SUCLG1P53597 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLG1P53597 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms