Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms