Protein–RNA interactions for Protein: P52434

POLR2H, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2HP52434 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2HP52434 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2HP52434 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2HP52434 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms