Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK3P51956 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK3P51956 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK3P51956 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK3P51956 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK3P51956 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK3P51956 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK3P51956 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK3P51956 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK3P51956 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK3P51956 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK3P51956 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK3P51956 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK3P51956 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK3P51956 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK3P51956 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK3P51956 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK3P51956 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK3P51956 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK3P51956 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK3P51956 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK3P51956 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK3P51956 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK3P51956 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK3P51956 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK3P51956 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK3P51956 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK3P51956 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK3P51956 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK3P51956 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK3P51956 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK3P51956 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK3P51956 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK3P51956 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK3P51956 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK3P51956 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK3P51956 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK3P51956 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK3P51956 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK3P51956 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK3P51956 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK3P51956 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK3P51956 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK3P51956 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK3P51956 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEK3P51956 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEK3P51956 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEK3P51956 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK3P51956 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK3P51956 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK3P51956 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK3P51956 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK3P51956 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK3P51956 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK3P51956 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK3P51956 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK3P51956 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK3P51956 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK3P51956 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK3P51956 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK3P51956 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK3P51956 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK3P51956 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK3P51956 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK3P51956 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK3P51956 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK3P51956 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK3P51956 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK3P51956 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK3P51956 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK3P51956 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK3P51956 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEK3P51956 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK3P51956 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK3P51956 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK3P51956 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK3P51956 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK3P51956 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK3P51956 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK3P51956 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK3P51956 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK3P51956 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK3P51956 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK3P51956 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK3P51956 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK3P51956 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK3P51956 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK3P51956 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK3P51956 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK3P51956 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK3P51956 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK3P51956 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK3P51956 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK3P51956 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK3P51956 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK3P51956 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK3P51956 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK3P51956 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK3P51956 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK3P51956 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms