Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
SMARCA2P51531 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
SMARCA2P51531 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC45.07■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC45.05■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC45.01■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
SMARCA2P51531 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC44.99■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
SMARCA2P51531 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
SMARCA2P51531 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC44.87■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
SMARCA2P51531 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms