Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUMBP49757 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUMBP49757 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUMBP49757 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUMBP49757 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUMBP49757 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUMBP49757 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUMBP49757 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUMBP49757 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUMBP49757 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUMBP49757 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUMBP49757 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUMBP49757 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUMBP49757 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUMBP49757 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUMBP49757 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NUMBP49757 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUMBP49757 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUMBP49757 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUMBP49757 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NUMBP49757 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUMBP49757 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUMBP49757 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUMBP49757 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUMBP49757 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUMBP49757 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUMBP49757 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUMBP49757 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUMBP49757 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUMBP49757 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUMBP49757 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUMBP49757 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUMBP49757 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUMBP49757 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUMBP49757 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUMBP49757 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUMBP49757 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUMBP49757 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUMBP49757 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUMBP49757 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUMBP49757 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUMBP49757 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUMBP49757 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUMBP49757 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUMBP49757 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUMBP49757 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUMBP49757 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUMBP49757 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUMBP49757 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUMBP49757 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUMBP49757 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUMBP49757 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUMBP49757 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUMBP49757 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUMBP49757 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUMBP49757 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUMBP49757 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUMBP49757 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUMBP49757 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUMBP49757 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUMBP49757 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUMBP49757 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUMBP49757 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUMBP49757 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUMBP49757 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUMBP49757 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUMBP49757 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUMBP49757 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUMBP49757 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUMBP49757 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUMBP49757 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUMBP49757 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUMBP49757 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUMBP49757 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUMBP49757 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUMBP49757 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUMBP49757 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NUMBP49757 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUMBP49757 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUMBP49757 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUMBP49757 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUMBP49757 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUMBP49757 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUMBP49757 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUMBP49757 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUMBP49757 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUMBP49757 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUMBP49757 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUMBP49757 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUMBP49757 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUMBP49757 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUMBP49757 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUMBP49757 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUMBP49757 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUMBP49757 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUMBP49757 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUMBP49757 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUMBP49757 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUMBP49757 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUMBP49757 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms