Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB3P49720 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms