Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRIM1P49642 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRIM1P49642 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRIM1P49642 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms