Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTDSS1P48651 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTDSS1P48651 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTDSS1P48651 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTDSS1P48651 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTDSS1P48651 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTDSS1P48651 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTDSS1P48651 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTDSS1P48651 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTDSS1P48651 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTDSS1P48651 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1P48651 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms