Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NMUP48645 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NMUP48645 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NMUP48645 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMUP48645 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMUP48645 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMUP48645 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMUP48645 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMUP48645 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMUP48645 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMUP48645 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMUP48645 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMUP48645 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMUP48645 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMUP48645 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMUP48645 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMUP48645 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMUP48645 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMUP48645 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMUP48645 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NMUP48645 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMUP48645 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMUP48645 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMUP48645 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMUP48645 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMUP48645 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMUP48645 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMUP48645 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMUP48645 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMUP48645 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMUP48645 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMUP48645 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMUP48645 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMUP48645 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMUP48645 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMUP48645 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMUP48645 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMUP48645 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMUP48645 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NMUP48645 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMUP48645 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMUP48645 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMUP48645 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMUP48645 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMUP48645 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMUP48645 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMUP48645 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMUP48645 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMUP48645 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMUP48645 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMUP48645 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMUP48645 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMUP48645 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMUP48645 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMUP48645 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMUP48645 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMUP48645 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMUP48645 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMUP48645 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMUP48645 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms