Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX9P48436 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX9P48436 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX9P48436 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX9P48436 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX9P48436 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX9P48436 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX9P48436 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX9P48436 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX9P48436 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX9P48436 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX9P48436 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX9P48436 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX9P48436 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX9P48436 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX9P48436 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX9P48436 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX9P48436 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX9P48436 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX9P48436 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX9P48436 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX9P48436 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX9P48436 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX9P48436 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX9P48436 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX9P48436 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX9P48436 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX9P48436 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX9P48436 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX9P48436 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX9P48436 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX9P48436 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX9P48436 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX9P48436 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX9P48436 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX9P48436 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX9P48436 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX9P48436 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX9P48436 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX9P48436 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX9P48436 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX9P48436 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX9P48436 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX9P48436 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX9P48436 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX9P48436 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX9P48436 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX9P48436 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX9P48436 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX9P48436 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX9P48436 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX9P48436 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX9P48436 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX9P48436 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX9P48436 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX9P48436 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX9P48436 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX9P48436 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX9P48436 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX9P48436 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX9P48436 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX9P48436 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX9P48436 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX9P48436 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX9P48436 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX9P48436 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX9P48436 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX9P48436 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX9P48436 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX9P48436 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX9P48436 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX9P48436 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX9P48436 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX9P48436 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX9P48436 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX9P48436 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX9P48436 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX9P48436 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX9P48436 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX9P48436 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX9P48436 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX9P48436 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX9P48436 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX9P48436 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX9P48436 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX9P48436 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX9P48436 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX9P48436 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms