Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX2P48431 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX2P48431 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX2P48431 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX2P48431 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX2P48431 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX2P48431 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX2P48431 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX2P48431 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX2P48431 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX2P48431 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX2P48431 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX2P48431 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX2P48431 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX2P48431 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOX2P48431 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOX2P48431 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX2P48431 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX2P48431 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX2P48431 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX2P48431 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX2P48431 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX2P48431 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX2P48431 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX2P48431 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX2P48431 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX2P48431 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX2P48431 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX2P48431 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX2P48431 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX2P48431 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX2P48431 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX2P48431 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX2P48431 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX2P48431 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX2P48431 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX2P48431 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX2P48431 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX2P48431 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX2P48431 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX2P48431 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX2P48431 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX2P48431 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX2P48431 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX2P48431 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX2P48431 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX2P48431 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX2P48431 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX2P48431 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX2P48431 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX2P48431 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX2P48431 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX2P48431 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX2P48431 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX2P48431 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOX2P48431 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX2P48431 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX2P48431 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX2P48431 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX2P48431 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX2P48431 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX2P48431 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX2P48431 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX2P48431 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX2P48431 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX2P48431 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX2P48431 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX2P48431 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX2P48431 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX2P48431 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX2P48431 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX2P48431 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX2P48431 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX2P48431 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX2P48431 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX2P48431 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX2P48431 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX2P48431 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX2P48431 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX2P48431 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX2P48431 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX2P48431 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX2P48431 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX2P48431 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX2P48431 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX2P48431 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX2P48431 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX2P48431 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX2P48431 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX2P48431 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX2P48431 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX2P48431 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX2P48431 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX2P48431 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX2P48431 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX2P48431 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX2P48431 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX2P48431 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX2P48431 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX2P48431 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms