Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC4P43686 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC4P43686 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC4P43686 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC4P43686 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms