Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANBP1P43487 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP1P43487 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP1P43487 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms