Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYKP43405 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYKP43405 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYKP43405 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYKP43405 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYKP43405 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYKP43405 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYKP43405 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYKP43405 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYKP43405 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYKP43405 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYKP43405 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYKP43405 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYKP43405 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYKP43405 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYKP43405 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYKP43405 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYKP43405 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYKP43405 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYKP43405 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYKP43405 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYKP43405 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYKP43405 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYKP43405 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYKP43405 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYKP43405 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYKP43405 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYKP43405 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYKP43405 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYKP43405 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYKP43405 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYKP43405 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYKP43405 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYKP43405 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYKP43405 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYKP43405 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYKP43405 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYKP43405 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYKP43405 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYKP43405 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYKP43405 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYKP43405 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYKP43405 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYKP43405 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYKP43405 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYKP43405 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYKP43405 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYKP43405 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYKP43405 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYKP43405 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYKP43405 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYKP43405 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYKP43405 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYKP43405 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYKP43405 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYKP43405 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYKP43405 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYKP43405 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYKP43405 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYKP43405 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYKP43405 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYKP43405 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYKP43405 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYKP43405 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYKP43405 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYKP43405 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYKP43405 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYKP43405 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYKP43405 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYKP43405 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYKP43405 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYKP43405 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYKP43405 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYKP43405 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYKP43405 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYKP43405 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYKP43405 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYKP43405 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms