Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A3P43003 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A3P43003 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms