Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VHLP40337 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VHLP40337 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VHLP40337 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VHLP40337 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VHLP40337 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VHLP40337 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VHLP40337 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VHLP40337 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VHLP40337 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VHLP40337 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VHLP40337 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VHLP40337 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VHLP40337 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VHLP40337 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VHLP40337 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VHLP40337 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VHLP40337 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VHLP40337 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VHLP40337 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VHLP40337 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VHLP40337 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VHLP40337 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VHLP40337 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VHLP40337 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VHLP40337 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VHLP40337 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VHLP40337 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VHLP40337 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VHLP40337 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VHLP40337 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VHLP40337 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VHLP40337 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VHLP40337 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VHLP40337 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VHLP40337 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VHLP40337 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VHLP40337 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VHLP40337 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VHLP40337 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VHLP40337 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VHLP40337 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VHLP40337 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VHLP40337 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VHLP40337 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VHLP40337 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VHLP40337 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VHLP40337 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VHLP40337 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VHLP40337 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VHLP40337 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VHLP40337 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VHLP40337 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VHLP40337 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VHLP40337 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VHLP40337 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VHLP40337 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VHLP40337 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VHLP40337 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VHLP40337 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VHLP40337 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VHLP40337 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VHLP40337 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VHLP40337 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VHLP40337 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VHLP40337 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VHLP40337 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VHLP40337 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VHLP40337 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VHLP40337 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VHLP40337 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VHLP40337 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VHLP40337 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VHLP40337 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VHLP40337 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VHLP40337 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VHLP40337 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VHLP40337 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VHLP40337 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VHLP40337 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VHLP40337 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VHLP40337 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VHLP40337 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VHLP40337 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VHLP40337 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VHLP40337 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VHLP40337 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VHLP40337 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VHLP40337 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLP40337 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLP40337 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLP40337 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLP40337 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLP40337 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLP40337 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLP40337 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLP40337 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLP40337 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLP40337 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLP40337 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms