Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGCXP38435 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGCXP38435 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GGCXP38435 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGCXP38435 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGCXP38435 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGCXP38435 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGCXP38435 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGCXP38435 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGCXP38435 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGCXP38435 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGCXP38435 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGCXP38435 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGCXP38435 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGCXP38435 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGCXP38435 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGCXP38435 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGCXP38435 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGCXP38435 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGCXP38435 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGCXP38435 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGCXP38435 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGCXP38435 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGCXP38435 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGCXP38435 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGCXP38435 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGCXP38435 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGCXP38435 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGCXP38435 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGCXP38435 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGCXP38435 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGCXP38435 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGCXP38435 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGCXP38435 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GGCXP38435 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGCXP38435 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGCXP38435 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGCXP38435 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGCXP38435 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGCXP38435 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGCXP38435 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGCXP38435 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGCXP38435 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGCXP38435 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGCXP38435 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGCXP38435 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGCXP38435 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGCXP38435 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GGCXP38435 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGCXP38435 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGCXP38435 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGCXP38435 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GGCXP38435 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GGCXP38435 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGCXP38435 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGCXP38435 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGCXP38435 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGCXP38435 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGCXP38435 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GGCXP38435 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGCXP38435 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGCXP38435 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGCXP38435 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGCXP38435 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGCXP38435 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGCXP38435 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGCXP38435 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGCXP38435 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGCXP38435 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGCXP38435 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGCXP38435 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGCXP38435 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGCXP38435 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGCXP38435 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGCXP38435 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGCXP38435 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGCXP38435 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGCXP38435 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGCXP38435 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGCXP38435 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGCXP38435 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGCXP38435 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGCXP38435 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGCXP38435 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGCXP38435 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GGCXP38435 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGCXP38435 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGCXP38435 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGCXP38435 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGCXP38435 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGCXP38435 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGCXP38435 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGCXP38435 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGCXP38435 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGCXP38435 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGCXP38435 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GGCXP38435 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGCXP38435 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGCXP38435 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGCXP38435 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.5 ms