Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FDFT1P37268 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FDFT1P37268 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FDFT1P37268 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms