Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2IP36954 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2IP36954 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms