Protein–RNA interactions for Protein: P35789

ZNF93, Zinc finger protein 93, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF93P35789 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF93P35789 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF93P35789 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF93P35789 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF93P35789 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF93P35789 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF93P35789 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF93P35789 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF93P35789 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms