Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH11P35749 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH11P35749 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH11P35749 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH11P35749 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH11P35749 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH11P35749 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH11P35749 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH11P35749 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH11P35749 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH11P35749 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH11P35749 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH11P35749 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH11P35749 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH11P35749 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH11P35749 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH11P35749 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH11P35749 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH11P35749 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH11P35749 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH11P35749 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH11P35749 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH11P35749 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH11P35749 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH11P35749 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH11P35749 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH11P35749 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYH11P35749 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYH11P35749 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MYH11P35749 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYH11P35749 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH11P35749 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH11P35749 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH11P35749 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH11P35749 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH11P35749 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH11P35749 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH11P35749 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH11P35749 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH11P35749 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH11P35749 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH11P35749 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH11P35749 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH11P35749 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH11P35749 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH11P35749 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH11P35749 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH11P35749 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH11P35749 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH11P35749 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH11P35749 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH11P35749 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH11P35749 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH11P35749 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYH11P35749 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH11P35749 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH11P35749 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH11P35749 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH11P35749 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH11P35749 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYH11P35749 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYH11P35749 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYH11P35749 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYH11P35749 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYH11P35749 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH11P35749 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH11P35749 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH11P35749 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH11P35749 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH11P35749 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH11P35749 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH11P35749 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH11P35749 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH11P35749 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH11P35749 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH11P35749 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH11P35749 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH11P35749 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH11P35749 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH11P35749 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH11P35749 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH11P35749 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH11P35749 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH11P35749 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
MYH11P35749 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH11P35749 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH11P35749 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH11P35749 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH11P35749 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH11P35749 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH11P35749 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH11P35749 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYH11P35749 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYH11P35749 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYH11P35749 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYH11P35749 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYH11P35749 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYH11P35749 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH11P35749 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYH11P35749 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms