Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX5P35711 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX5P35711 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX5P35711 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX5P35711 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX5P35711 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX5P35711 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX5P35711 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX5P35711 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX5P35711 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX5P35711 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX5P35711 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX5P35711 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX5P35711 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX5P35711 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX5P35711 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX5P35711 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX5P35711 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX5P35711 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX5P35711 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX5P35711 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX5P35711 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX5P35711 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX5P35711 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX5P35711 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX5P35711 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX5P35711 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX5P35711 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX5P35711 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX5P35711 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX5P35711 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX5P35711 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX5P35711 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX5P35711 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX5P35711 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX5P35711 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX5P35711 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX5P35711 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX5P35711 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX5P35711 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX5P35711 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX5P35711 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX5P35711 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX5P35711 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX5P35711 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX5P35711 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX5P35711 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX5P35711 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX5P35711 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX5P35711 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX5P35711 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX5P35711 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX5P35711 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX5P35711 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX5P35711 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX5P35711 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX5P35711 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX5P35711 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX5P35711 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX5P35711 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX5P35711 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX5P35711 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX5P35711 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX5P35711 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX5P35711 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SOX5P35711 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX5P35711 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX5P35711 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX5P35711 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX5P35711 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX5P35711 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX5P35711 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX5P35711 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX5P35711 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX5P35711 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX5P35711 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX5P35711 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX5P35711 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX5P35711 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX5P35711 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms