Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDIT3P35638 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDIT3P35638 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DDIT3P35638 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
DDIT3P35638 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms