Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBSP35520 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBSP35520 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBSP35520 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CBSP35520 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBSP35520 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CBSP35520 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBSP35520 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBSP35520 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBSP35520 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBSP35520 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBSP35520 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBSP35520 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBSP35520 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBSP35520 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBSP35520 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBSP35520 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBSP35520 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBSP35520 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBSP35520 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBSP35520 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBSP35520 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBSP35520 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBSP35520 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBSP35520 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBSP35520 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBSP35520 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBSP35520 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBSP35520 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CBSP35520 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBSP35520 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBSP35520 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CBSP35520 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBSP35520 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBSP35520 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBSP35520 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBSP35520 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBSP35520 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBSP35520 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CBSP35520 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBSP35520 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBSP35520 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBSP35520 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CBSP35520 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBSP35520 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBSP35520 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBSP35520 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBSP35520 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBSP35520 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBSP35520 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBSP35520 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBSP35520 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBSP35520 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBSP35520 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBSP35520 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBSP35520 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBSP35520 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBSP35520 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CBSP35520 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBSP35520 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBSP35520 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBSP35520 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBSP35520 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CBSP35520 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBSP35520 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBSP35520 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBSP35520 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBSP35520 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBSP35520 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBSP35520 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBSP35520 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBSP35520 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBSP35520 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBSP35520 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBSP35520 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBSP35520 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBSP35520 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms