Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH5P33151 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH5P33151 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDH5P33151 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDH5P33151 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH5P33151 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH5P33151 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH5P33151 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH5P33151 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH5P33151 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH5P33151 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH5P33151 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH5P33151 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH5P33151 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH5P33151 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH5P33151 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH5P33151 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH5P33151 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH5P33151 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH5P33151 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH5P33151 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH5P33151 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH5P33151 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH5P33151 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH5P33151 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH5P33151 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH5P33151 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH5P33151 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH5P33151 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH5P33151 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH5P33151 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH5P33151 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH5P33151 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH5P33151 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH5P33151 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH5P33151 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH5P33151 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH5P33151 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH5P33151 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH5P33151 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH5P33151 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH5P33151 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH5P33151 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH5P33151 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH5P33151 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH5P33151 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH5P33151 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH5P33151 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH5P33151 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH5P33151 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH5P33151 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH5P33151 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH5P33151 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH5P33151 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH5P33151 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH5P33151 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH5P33151 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH5P33151 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH5P33151 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH5P33151 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH5P33151 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH5P33151 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH5P33151 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH5P33151 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH5P33151 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH5P33151 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH5P33151 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH5P33151 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH5P33151 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH5P33151 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH5P33151 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH5P33151 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH5P33151 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH5P33151 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH5P33151 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH5P33151 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH5P33151 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH5P33151 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH5P33151 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH5P33151 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH5P33151 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH5P33151 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH5P33151 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH5P33151 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH5P33151 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH5P33151 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH5P33151 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH5P33151 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH5P33151 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH5P33151 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH5P33151 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms