Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA3P32297 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA3P32297 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA3P32297 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA3P32297 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA3P32297 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms