Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMA5P28066 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PSMA5P28066 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSMA5P28066 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMA5P28066 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms