Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLNP26678 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLNP26678 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLNP26678 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLNP26678 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLNP26678 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLNP26678 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLNP26678 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLNP26678 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLNP26678 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLNP26678 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLNP26678 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLNP26678 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLNP26678 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLNP26678 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLNP26678 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLNP26678 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLNP26678 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLNP26678 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLNP26678 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLNP26678 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLNP26678 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLNP26678 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLNP26678 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLNP26678 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLNP26678 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLNP26678 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLNP26678 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLNP26678 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLNP26678 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLNP26678 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLNP26678 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLNP26678 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLNP26678 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLNP26678 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLNP26678 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLNP26678 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLNP26678 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLNP26678 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLNP26678 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLNP26678 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLNP26678 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLNP26678 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLNP26678 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLNP26678 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLNP26678 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLNP26678 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLNP26678 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLNP26678 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLNP26678 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLNP26678 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLNP26678 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLNP26678 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLNP26678 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms